從2003年開始的食用菌工廠化，使中國整個食用菌行業產生了深刻的變革，未來食用菌行業將如何發展是值得思考的問題，有這幾個趨勢可以有想法。
一、強者的世界，資本與食用菌
在眾興菌業和雪榕生物成功在A股上市之后，讓眾多的食用菌企業老板明確或者堅定了未來的發展方向是什么，就是上市，現在至少有不下5家食用菌企業將目標定位在主板上市，未來3-5年，將會有接近10家食用菌企業(或者含有食用菌概念的企業)開始主板上市之路，食用菌工廠化是典型的重資產行業，資本的力量讓食用菌行業的強者更加的強大，走向上市。數量更多的不具備主板上市條件的食用菌企業選擇了在新三板掛牌。
不管結局如何，未來5年，都將繼續是資本與食用菌企業結合更加緊密的時期，是兩者各取所需的必然結果，資本將使食用菌行業產生更加深刻的變革，強者更強。
二、小型工廠化開始起步
中國人工栽培的食用菌品種眾多，并不是所有的品種都會產生巨無霸型的大型工廠化企業，平菇、雞腿菇、茶樹菇、草菇等不耐運輸，不適合大型工廠化的品種，在未來5年內，將逐步過渡到小型工廠化階段。
現在一個家庭種一個棚的平菇，也就是滿足基本的生活。然而，現在和以后的年輕人從事食用菌將不再是以前的夫妻家庭模式，小型工廠化將成為主要模式，用工數量在10人左右，日產鮮菇1-2噸，小型工廠化將成為未來食用菌行業重要的組成部分。
三、液體菌種的時代
瓶栽金針菇和瓶栽杏鮑菇開始采用液體菌種，袋栽杏鮑菇正在完成由固體菌種向液體菌種的過渡，這一過程將在3年內完成。袋栽海鮮菇液體菌種技術已經完全成熟，一些率先采用液體菌種的海鮮菇工廠各方面運行良好，吸引了眾多企業前往考察，海鮮菇將成為繼杏鮑菇改液體菌種熱潮之后的又一品種。瓶栽蟹味菇、白玉菇的液體菌種工藝早已成熟，只是一些企業這方面過于保守，隨著觀念的改變，液體菌種將很快全面在瓶栽蟹味菇和白玉菇上應用。現在，對于草菇、雙孢菇等草腐菌應用液體菌種，很多企業已經走在嘗試的路上。
創新，改變，將成為未來5年中國食用菌行業的發展核心，菌種是食用菌生產的重要一個環節。
四、新品種馴化進入高潮期
隨著常規品種市場的飽和，競爭的加劇，更多的企業和個人開始將更多的經歷投入到野生珍貴食藥用菌馴化的工作上來，羊肚菌和牛肝菌的馴化成功也給大家的馴化工作帶來了希望，中國幅員遼闊，物種豐富，幾乎每個地區都有值得馴化的野生食用菌。野生菌馴化不僅需要技術，更需要的是耐心，投入了時間，投入了大量的資金，然而未必一定會成功，這更是野生菌馴化的魅力，巨大的收益像是一座金礦一樣，吸引著技術和資金的投入，這需要一個長期的過程，即使馴化成功，再到商業化栽培也需要很長一段時間。
野生菌馴化對于食用菌技術人員，不僅僅是商業目的，更多的是馴化過程中的樂趣，能做一件既有價值，又有樂趣的事，是大多食用菌技術員的愿望。
五、食用菌深加工規模擴大
即食類、脆片類、蘑菇醬類、菇精類等食用菌深加工規模將在未來5年迅速擴大，表面上看是食用菌行業鮮品深度競爭的結果，實際上是食用菌行業良性發展的需要，隨著從13年到16年的食用菌工廠化規模的擴大，鮮品利潤隨之下降，以及隨時可能到來的行情暴跌，越來越多的食用菌企業意識到深加工重要性，開始把精力和資金投入到食用菌產品的深加工上，隨著市場的推廣，消費者也將越來越認可食用菌深加工產品。
鮮品為王的時代已經過去了，只有深加工才能有效化解隨時爆發的產能過剩，同時也將是未來食用菌行業新的機會。
六、更多的退出者，注定的無奈
炎帝農業以租賃的方式，結束了香菇帝國的夢想，盡管炎帝農業走到今天這種地步原因很多，也很復雜，但這在中國食用菌行業絕不是個案，更不是結束，在未來的5年內，將會陸續出現類似炎帝農業的案例。將會有一批資金或者企業退出食用菌行業，這是行業內部競爭的必然結果，也是中國食用菌行業畸形發展的必然結果，這些企業共同的特點是：政府扶持、貸款壓力、管理不善、技術落后……，其中任何一點都有可能成為壓死駱駝的最后一根稻草。
七、食用菌產業走向世界
歐洲和美國在雙孢菇栽培上處于領先地位，而在以金針菇、杏鮑菇為代表的木腐菌上中國在技術和資金上已經具有優勢，在未來的5年內，將會有一批企業和個人到歐洲、美國、加拿大、非洲以及南亞等國家和地區建設食用菌工廠，品種從現在的香菇為主，發展到金針菇、杏鮑菇、平菇等，遍布在世界各地的華人將是這些工廠最早一批消費者，這些品種將會逐漸獲得這些國家消費者的認可，中國蘑菇，香飄世界。未來5年將進入投資高峰期，中國食用菌，走向世界。
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