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質配是指2個可親和的性器官或性細胞的細胞質結合在同一細胞中，細胞核也隨細胞質進入同一個細胞。此時菌絲細胞含有有來自2個親本的各1個細胞核，此時的菌絲體被稱為雙核體。經過質配進入同一細胞內的2個細胞核進行融合稱為核配。

食用菌有性繁殖體包括擔子菌和子囊菌的擔孢子和子囊孢子。

 

羊肚菌、冬蟲夏草、蛹蟲草、塊菌（松露）、馬鞍菌等子囊菌形成子囊孢子，子囊孢子的顏色有褐色、黑色、紫色或無色，形狀有球形、梭形、橢圓形、線形等。

 

平菇、香菇、金針菇、銀耳等擔子菌形成擔孢子，擔孢子一般為淺色或無色，形狀圓形、橢圓形等，子實體在成熟過程中孢子不斷釋放堆積形成紅褐色（靈芝）、白色（平菇）、淡粉色（紫丁香蘑）等孢子印，用梅爾澤試劑對擔孢子染色，根據顏色反應可將擔孢子分為淀粉質、非淀粉質、擬淀粉質型，對應質型反應顏色為藍色、無色或略帶淡黃色、淺黃褐色或淺紅褐色。

 

食用菌無性繁殖體包括厚垣孢子（草菇）、粉孢子（金針菇）等。

 

厚垣孢子由于食用菌菌絲細胞壁增厚、原生質體在厚壁細胞中濃縮而形成的，如草菇的厚垣孢子具有抵抗不良環境的能力，如干旱、低溫等。環境條件適宜時，厚垣孢子可又萌發生長出菌絲。粉孢子是通過菌絲斷裂形成的分生孢子，金針菇的雙核氣生菌絲上容易形成粉孢子，粉孢子在適合的條件下萌發形成菌絲體進行無性繁殖，這種菌絲體結實能力很差，粉孢子的數量越多對金針菇產量影響越大。（來源：梁小菇）